Изобретение относится к биотехнологии, а именно к биологическому препарату для очистки загрязненной нефтью и нефтепродуктами почвы при одновременном восстановлении ее физико-химических свойств и естественного биоценоза. Биопрепарат-нефтедеструктор включает культуру бактерий и микробное удобрение в виде ферментированного подстилочного птичьего помета, содержащее нативные микроорганизмы: Clavibacter michiganese, Bacillus amyloliquefaciens, Micrococcus varians. В качестве культуры бактерий использован штамм Bacillus cereus 3K с титром 1012 клеток/г микробного удобрения. Изобретение позволяет повысить нефтедеструктирующую активность, стимулировать развитие нефтеокисляющей микрофлоры, увеличить скорость разложения нефти, обеспечить интенсификацию микробных процессов, восстанавливающую агрохимические свойства почвы, проводить очистку нефтезагрязненных почв в районах с коротким тепловым периодом.